Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Habp4Q9JKS5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Habp4Q9JKS5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms