Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tuba8Q9JJZ2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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