Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pgpep1Q9ESW8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms