Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms