Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufs3Q9DCT2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufs3Q9DCT2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms