Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms