Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tmem239Q9DA47 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tmem239Q9DA47 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem239Q9DA47 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem239Q9DA47 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms