Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms