Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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