Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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