Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms