Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp4bQ9D8B3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms