Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp2c55Q9D816 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms