Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PudpQ9D5U5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PudpQ9D5U5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms