Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zcchc13Q9D548 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms