Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh2Q9D489 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms