Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap53Q9D439 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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