Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms