Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chordc1Q9D1P4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms