Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms