Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmem53Q9D0Z3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmem53Q9D0Z3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem53Q9D0Z3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tmem53Q9D0Z3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tmem53Q9D0Z3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tmem53Q9D0Z3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tmem53Q9D0Z3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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