Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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