Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms