Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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