Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mis18aQ9CZJ6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms