Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CYI0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CYI0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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