Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Khdc3Q9CWU5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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