Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms