Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms