Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pard3bQ9CSB4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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