Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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