Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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