Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccer1Q9CQL2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms