Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms