Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl11Q9CQF0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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