Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms