Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms