Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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