Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubl4bQ9CQ84 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms