Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Use1Q9CQ56 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Use1Q9CQ56 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Use1Q9CQ56 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Use1Q9CQ56 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Use1Q9CQ56 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Use1Q9CQ56 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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