Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim26Q99PN3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms