Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms