Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cntnap4Q99P47 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap4Q99P47 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms