Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sf3b1Q99NB9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms