Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl3Q99N95 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl3Q99N95 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl3Q99N95 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl3Q99N95 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl3Q99N95 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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