Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp1b4Q99ME6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms