Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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