Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms