Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ciao1Q99KN2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ciao1Q99KN2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ciao1Q99KN2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ciao1Q99KN2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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