Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlcd1Q99JT6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms